多数学者均认同环境因素与遗传因素相互作用导致了自闭症ASD发生，但迄今并未发现确定的环境致病因素。

　　自闭症ASD的遗传易感性

　　近二十年ASD研究最令人振奋的是遗传和基因致病因素的发现。

　　1999年Huda Zoghbi首先发现Rett综合征存在Mecp2基因突变;2008年Weiss LA等报道了16p11.2微缺失和微重复与ASD的相关;2014年Bernier R发现CHD8基因变异可导致ASD;其他主要发现包括Shank3、SCN2、Pten等基因变异。

　　迄今已经在超过10%的自闭症ASD人群中发现了新发(de novo)或遗传性(inherited)的单基因异常或拷贝数变异(copy number variation，CNV)，逾百个基因被认定为ASD致病基因，还有上千个基因被认为属于自闭症ASD致病候选基因。

　　这充分说明了自闭症ASD基因异常的异质性。

　　这些基因异常的发现以及相继开展的动物模型实验大大增进了我们对自闭症ASD遗传机制的理解，为全面揭示ASD遗传病因和发病机制打下了一定的基础。

　　然而，上述单基因异常导致的多为综合症性ASD(syndromic autism)，综合征性自闭症ASD患者除了具有ASD特征，也同时存在不同程度的全面发育迟缓或智力障碍、特殊外貌等，与所谓非症候群性自闭症(non-syndromic autism)或经典ASD(classical autism)多数具有正常外貌，多数(50%-70%)不存在智力障碍和全面发育迟缓有很大不同。

　　研究发现经典ASD的遗传异常可能源于多个基因常见变异(common variations)，如单核苷酸变异(Single nucleotide variations，SNV)，包括新发的和遗传性的，这些变异过去认为“不致病”，没有明确临床意义，但目前推测可能以数量性状遗传或加性效应(addictive effect)方式增加个体ASD的遗传易感性。

　　其中一些基因作用较大，称为主效基因(master gene)，一些基因作用小，称为微效基因。

　　如果个体变异的基因数量大，或者包含了主效基因异常，则遗传易感性大，反之亦然。

　　目前多基因遗传性疾病研究技术尚不成熟，尚不能对自闭症ASD诊断和干预提供足够的支持，但不远的将来，结合全基因组测序和人工智能、机器学习和大数据分析发展起来的多基因风险评分(polygenic risk score，PRS)技术可能在揭示ASD遗传机制方面发挥重要作用。

　　自闭症ASD在人群中患病率为1%，同卵双生子高达80%到90%的ASD同病率，异卵双生和同胞18%的ASD同病率，ASD特征与广泛孤独症表型(broad autism phenotype，BAP)存在明显家族聚集性，遗传因素在ASD病因中所扮演的重要作用不言而喻。